La revista Free Software Magazine hace una larga comparación de los dos sistemas operativos *nix más populares hoy en día: GNU/Linux, inispirado en MINIX, y FreeBSD, basado en la Berkeley Software Distribution (BSD), a su vez, una modificación del UNIX de AT&T hecha por la Universidad de California.

Quizás la diferencia más importante entre ambos es que, para evitar problemas legales, el proyecto de FreeBSD decidió hacer una completa re-ingeniería de BSD original en lugar de copiar su código fuente, desarrollando todo el sistema operativo; mientras que, al contrario, en GNU/Linux todos sus componentes son desarrollados independientemente uno de otro y finalmente son "unidos" por cada una de sus distribuciones disponibles.

Hay, obviamente, muchas otras diferencias, la mayoría de las cuales se enumera en esa comparación.

Así, las principales diferencias técnicas entre ambos pueden dividirse en:

• Nombres de dispositivos.
• Niveles de ejecución y scripts de inicialización.
• Shells (Bash para GNU/Linux, csh para FreeBSD).
• El Kernel (de hecho, más similitudes que diferencias).
• "Empaquetamiento" del software disponible (RPMs, DEBs, etc. para GNU/Linux; Ports para FreeBSD).

Sin embargo, la acertada conclusión de la comparación es que con los dos OS libres y abiertos y gratuitos, el verdadero ganador de enfrentar a ambos es la comunidad.